Двосторонніми органами високого рівня є Українсько-австрійська змішана комісія з питань торговельно-економічних зв’язків, Українсько-австрійська Спільна Комісія з питань науково-технічного співробітництва, Українсько-австрійська змішана комісія з питань міжнародних автомобільних перевезень та Українсько-австрійський Спільний комітет з питань комбінованого транспорту.
Українсько-австрійська змішана комісія з питань торговельно-економічних зв‘язків створена відповідно до ст. 12 Угоди між Україною та Республікою Австрія про двосторонні торговельно-економічні зв’язки від 31 серпня 1993 р. Українська частина Комісії є постійно діючим органом, який згідно з покладеними на нього функціями представляє Кабінет Міністрів України в його відносинах з урядом Австрії.
Основною функцією Комісії є сприяння розвитку двостороннього торговельно-економічного співробітництва між Україною та Республікою Австрія для задоволення інтересів та потреб обох країн.
13-те засідання Українсько-австрійської змішаної Комісії з питань торговельно-економічних зв’язків відбулося 16 травня 2017 р. у Києві, робоча зустріч співголів відбулася 29 травня 2018 р. у Відні, 14-те засідання відбулось 21 травня 2019 року в столиці Австрії.
Останнє засідання Українсько-австрійської Спільної Комісії з питань науково-технічного співробітництва (8-е засідання) відбулося 20 вересня 2018 року в Києві.
Останнє засідання Українсько-австрійської змішаної комісії з питань міжнародних автомобільних перевезень було проведено 21 лютого 2018 р. у Відні.
Засідання Спільного комітету з питань комбінованого транспорту відбулося у Відні 21 лютого 2018 р.